記者7月14日從中國科學(xué)院西北高原生物研究所獲悉，該所動(dòng)物生態(tài)與資源保護(hù)研究團(tuán)隊(duì)首次構(gòu)建了涵蓋多個(gè)物種的鹿科動(dòng)物腸道宏基因組圖譜，建立了當(dāng)前最為系統(tǒng)、全面的鹿科動(dòng)物腸道微生物組數(shù)據(jù)庫。相關(guān)研究成果日前發(fā)表于學(xué)術(shù)期刊《BMC生物學(xué)》。
青藏高原具有極端低氧、低溫以及營養(yǎng)匱乏等特殊環(huán)境條件，對(duì)野生動(dòng)物的生存構(gòu)成了嚴(yán)峻挑戰(zhàn)。腸道微生物作為宿主適應(yīng)外部環(huán)境的重要“隱形器官”，在能量代謝、營養(yǎng)吸收、免疫調(diào)節(jié)等方面發(fā)揮著關(guān)鍵作用。
中國科學(xué)院西北高原生物研究所動(dòng)物生態(tài)與資源保護(hù)研究團(tuán)隊(duì)研究員張同作介紹，研究團(tuán)隊(duì)采集了青藏高原地區(qū)多種鹿科動(dòng)物的糞便樣本，并結(jié)合公共數(shù)據(jù)庫中平原地區(qū)鹿科動(dòng)物的樣本進(jìn)行分析。通過宏基因組組裝，研究團(tuán)隊(duì)共獲得了41847個(gè)宏基因組組裝基因組，并構(gòu)建了3193個(gè)高質(zhì)量物種水平基因組，建立了目前最為系統(tǒng)、全面的鹿科動(dòng)物腸道微生物組數(shù)據(jù)庫。
張同作介紹，這是國內(nèi)外首個(gè)基于多物種、大規(guī)模宏基因組分析構(gòu)建的鹿科動(dòng)物腸道微生物資源庫，為微生物資源利用以及瀕危物種保護(hù)提供了堅(jiān)實(shí)的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。
張同作介紹，通過系統(tǒng)發(fā)育和共進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)，腸道微生物與宿主在長期演化過程中形成了穩(wěn)定的互利關(guān)系。更為關(guān)鍵的是，通過比較宏基因組分析，研究人員發(fā)現(xiàn)高原鹿科動(dòng)物的腸道微生物在能量代謝與碳水化合物活性酶通路上具有顯著的適應(yīng)性增強(qiáng)，其相關(guān)功能基因的相對(duì)豐度顯著高于平原鹿類。
記者7月14日從中國科學(xué)院西北高原生物研究所獲悉，該所動(dòng)物生態(tài)與資源保護(hù)研究團(tuán)隊(duì)首次構(gòu)建了涵蓋多個(gè)物種的鹿科動(dòng)物腸道宏基因組圖譜，建立了當(dāng)前最為系統(tǒng)、全面的鹿科動(dòng)物腸道微生物組數(shù)據(jù)庫。相關(guān)研究成果日前發(fā)表于學(xué)術(shù)期刊《BMC生物學(xué)》。
青藏高原具有極端低氧、低溫以及營養(yǎng)匱乏等特殊環(huán)境條件，對(duì)野生動(dòng)物的生存構(gòu)成了嚴(yán)峻挑戰(zhàn)。腸道微生物作為宿主適應(yīng)外部環(huán)境的重要“隱形器官”，在能量代謝、營養(yǎng)吸收、免疫調(diào)節(jié)等方面發(fā)揮著關(guān)鍵作用。
中國科學(xué)院西北高原生物研究所動(dòng)物生態(tài)與資源保護(hù)研究團(tuán)隊(duì)研究員張同作介紹，研究團(tuán)隊(duì)采集了青藏高原地區(qū)多種鹿科動(dòng)物的糞便樣本，并結(jié)合公共數(shù)據(jù)庫中平原地區(qū)鹿科動(dòng)物的樣本進(jìn)行分析。通過宏基因組組裝，研究團(tuán)隊(duì)共獲得了41847個(gè)宏基因組組裝基因組，并構(gòu)建了3193個(gè)高質(zhì)量物種水平基因組，建立了目前最為系統(tǒng)、全面的鹿科動(dòng)物腸道微生物組數(shù)據(jù)庫。
張同作介紹，這是國內(nèi)外首個(gè)基于多物種、大規(guī)模宏基因組分析構(gòu)建的鹿科動(dòng)物腸道微生物資源庫，為微生物資源利用以及瀕危物種保護(hù)提供了堅(jiān)實(shí)的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。
張同作介紹，通過系統(tǒng)發(fā)育和共進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)，腸道微生物與宿主在長期演化過程中形成了穩(wěn)定的互利關(guān)系。更為關(guān)鍵的是，通過比較宏基因組分析，研究人員發(fā)現(xiàn)高原鹿科動(dòng)物的腸道微生物在能量代謝與碳水化合物活性酶通路上具有顯著的適應(yīng)性增強(qiáng)，其相關(guān)功能基因的相對(duì)豐度顯著高于平原鹿類。
本文鏈接：http://jphkf.cn/news-2-2998-0.html鹿科動(dòng)物腸道微生物組數(shù)據(jù)庫建立
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