為提升各種場景下熒光成像性能,北京大學席鵬團隊和深圳大學屈軍樂團隊合作,另辟蹊徑,通過計算機視覺與熒光顯微的融合,提出了一種暗通道光學層切算法,僅用單幀圖像即可高效去除圖像的離焦背景,使顯微成像性能得到大幅提升,為深部生物組織研究、病理診斷及深層活體動態(tài)觀測開辟全新可能。相關(guān)成果日前發(fā)表在《自然·方法》上。
席鵬告訴記者,現(xiàn)代顯微成像技術(shù)之基石,在于克服樣品中熒光散射的技術(shù)突破,如多光子成像技術(shù)、光片顯微技術(shù)、組織透明化等。然而,基于光學的層切技術(shù)常常會帶來系統(tǒng)成本、時間分辨率與光毒性的提升,基于生物的層切技術(shù)又會導(dǎo)致樣品處理復(fù)雜性的提高。此外,即使是最先進的光學成像技術(shù),在面對深層樣本的成像中,依然會由于深層散射而產(chǎn)生離焦背景,影響對精細生物結(jié)構(gòu)的精準觀察。
暗通道新技術(shù)的提出,受到了自然圖像去霧啟發(fā)。研究團隊發(fā)現(xiàn),熒光圖像中的離焦背景與自然圖像的霧霾呈現(xiàn)出分布相似性。基于此,研究團隊開發(fā)了適用熒光圖像的背景去除技術(shù)——暗通道光學層切。該技術(shù)通過高低頻分離以保留圖像的弱小信號,僅將低頻部分進行去背景處理,并通過迭代濾除進行單次或多次的背景去除以適用不同場景。
通過聯(lián)合交叉驗證,研究團隊證明,這一新技術(shù)能基于寬場圖像達到共聚焦、光層切、雙光子成像效果,并能在深層組織成像時進一步提升光學層切能力。
研究團隊進一步展現(xiàn)了這項新技術(shù)在不同顯微成像中的應(yīng)用。在高通量光片成像中,它能顯著提升小鼠全腦成像質(zhì)量。在活體小動物成像當中,該技術(shù)能通過降低散射背景,提升小鼠身體組織的血管成像清晰度。在深層神經(jīng)元成像中,它能顯著提升基于深度學習的神經(jīng)元分割提取度,原先難以分辨的神經(jīng)元得以顯現(xiàn)?!翱梢哉f,這一新技術(shù)不僅能高效去除離焦背景,還可將熒光圖像變得更清晰。比如在病理研究中,它能獲得全組織的清晰三維病理信息,協(xié)助醫(yī)生進行綜合且全面的病理診斷,獲得更為精確的細胞核計數(shù)?!毕i說。
此外,研究團隊還驚喜發(fā)現(xiàn),暗通道新技術(shù)可廣泛應(yīng)用于提升不同光學顯微技術(shù)的硬件成像效果與重建算法效果。席鵬告訴記者:“它不僅適用于寬場成像、光片成像等硬件模態(tài),進一步提升光學層切與偏振解析能力,更適用于熒光漲落成像、二維或三維結(jié)構(gòu)光照明成像等,可顯著降低成像偽影,并進一步提升多種熒光圖像增強算法的分辨率?!?span style="display:none">bgj即熱新聞——關(guān)注每天科技社會生活新變化gihot.com
文章審稿人對這一成果給予了高度評價:“作者基于多種顯微成像數(shù)據(jù)對所提方法進行了全面驗證,其突出優(yōu)勢在于顯著提升了圖像分割的精度與保真度?!?span style="display:none">bgj即熱新聞——關(guān)注每天科技社會生活新變化gihot.com
席鵬告訴記者,通過計算機視覺與熒光顯微成像的組合創(chuàng)新,暗通道新技術(shù)無需額外的成像成本,極大提升了各類熒光成像模態(tài)的層切性能。未來,這一技術(shù)有望集成于各類顯微技術(shù),在不增加成本前提下提升顯微系統(tǒng)成像性能。
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